Les principales menaces auxquelles l'espèce est confrontée sont la surpêche, la pêche au filet maillant, les perturbations dues aux activités humaines et les attaques de prédateurs locaux et introduits. Le changement climatique et le réchauffement des océans peuvent affecter indirectement les manchots et leur taux de survie, par le biais de modifications de la circulation des courants et des effets sur les chaînes alimentaires. La pêche constitue une autre menace pour l'espèce. Ils meurent souvent empêtrés dans les filets de pêche ou sont chassés pour être consommés, pour servir d'appât ou pour être vendus comme animaux de compagnie. Il y a aussi l'exploitation excessive du guano, qui limite les lieux choisis par ces oiseaux pour nicher. D'autres facteurs d'influence sont la pollution de la mer, les perturbations humaines ou l'effet de prédateurs tels que les renards ou les chats.
Actions menées par la direction de la réserve :
Sensibilisation et éducation environnementale des différentes parties prenantes de l'ANP et de sa zone tampon, actions de suivi et de contrôle, suivi et contrôle avec les parties prenantes (pêcheurs) et avec les autorités, et évaluation des plans de gestion de l'extraction du guano des îles. Les efforts pour réglementer l'extraction du guano des îles ont été efficaces sur les îles où ils ont été appliqués, mais l'extraction sur de nombreuses îles n'est pas surveillée, et une extraction illégale a lieu dans certaines parties de l'aire de répartition de l'espèce.
